吴东东——中国科学院昆明动物所副研究员

吴东东，博士，中国科学院昆明动物所副研究员，硕士生导师，长期从事分子进化和生物信息学研究，2012年荣获中国科学院百篇优秀博士论文奖，2013年入选中国科学院青年创新促进会。他参与的“基因组多样性与亚洲人群的演化”项目获2013 年云南省自然科学奖特等奖，并入选2014年云南省十大科技进展；“动物适应性进化的分子机制”获2013 年云南省自然科学奖一等奖。

教育及工作经历：

2006-09--2011-01 中国科学院昆明动物研究所 博士

2002-09--2006-07 复旦大学，生命科学学院 学士

2011-01--今 中国科学院昆明动物研究所 副研究员

招生专业：

遗传学

基因组学

生物信息学

招生方向：

群体遗传学，分子进化，基因组进化，转录组进化

基因组进化

计算比较基因组学

研究方向：

长期从事分子进化和生物信息学研究。

承担科研项目情况：

1、利用从头合成起源新基因研究基因网络的起源与适应性进，主持，国家级，2013-01--2016-12 

2、老年痴呆症研究团队，参与，院级级，2013-01--2016-12 

3、中国科学院青促会专项基金，主持，院级级，2013-01--2016-12 

科研成果：

资料更新中……

1、 Genomic Analyses Reveal Potential Independent Adaptation to High Altitude in Tibetan Chickens.，Molecular Biology and Evolution，2015，通讯作者

2、 Recent Positive Selection Drives the Expansion of a Schizophrenia Risk Nonsynonymous Variant at SLC39A8 in Europeans.，Schizophrenia Bulletin，2015，第2作者

3、 Integrative analysis of young genes, positively selected genes and lncRNAs in the development of Drosophila melanogaster.，BMC Evol Biol，2015，通讯作者

4、 Population variation revealed high-altitude adaptation of tibetan mastiffs.，Molecular Biology and Evolution，2014，通讯作者

5、 Out of pollen hypothesis for origin of new genes in flowering plants: study from Arabidopsis thaliana.，Genome Biol Evol，2014，第1作者

6、 Domestication of the dog from the wolf was promoted by enhanced excitatory synaptic plasticity: a hypothesis.，Genome Biol Evol，2014，通讯作者

7、 Molecular evolution in the CREB1 signal pathway and a rare haplotype in CREB1 with genetic predisposition to schizophrenia.，J Psychiatr Res.，2014，第2作者

8、 Evolution and function of de novo originated genes，Molecular Phylogenetics and Evolution，2013，第1作者

9、 Artificial Selection on Brain-Expressed Genes during the Domestication of Dog.，Molecular Biology and Evolution， 2013,30(8):1867-76.，通讯作者

10、 Rapid Evolution of the Mammalian HILS1 Gene and the Nuclear Condensation Process during Mammalian Spermiogenesis，Journal of Genetics and Genomics ，2013，通讯作者 

11、 Evidence of recent natural selection on the Southeast Asian deletion (--(SEA)) causing α-thalassemia in South China.，BMC Evolutionary Biology ，2013，第2作者

12、 Positive selection on the osteoarthritis-risk and decreased-height associated variants at the GDF5 gene in East Asians，PLoS one，2012，第1作者

13、 The origin and evolution of variable number tandem repeat of CLEC4M gene in the global human population.，PLoS one ，2012，第3作者

14、 Positive selection on the gene RNASEL: correlation between patterns of evolution and function.，Molecular Biology and Evolution ，2012, 29(10): 3161-3168.，通讯作者 

15、 Correlated evolution among six gene families in Drosophila revealed by parallel change of gene numbers.，Genome Biology and Evolution，2011，第1作者

16、 Different level of population differentiation among human genes，BMC Evolutionary Biology ，2011，第1作者

17、 De novo origin of human protein-coding genes，PLoS Genetics，2011, 7(11): e1002379.，第1作者

18、 Multi-locus analysis reveals a different pattern of genetic diversity for mitochondrial and nuclear DNA between wild and domestic pigs in East Asia，PLoS one ，2011，第2作者

19、 Eukaryotic origin of a metabolic pathway in virus by horizontal gene transfer，Genomics，2011，第1作者
 
       20、褪黑激素通路基因多态性与日照时间的关联研究 季林丹; 徐进; 吴东东; 谢思达; 邓亮生; 张亚平 中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编 2011-08-09

21、 Association of disease-predisposition polymorphisms of the melatonin receptors and sunshine duration in the global human populations.，Journal of Pineal Research，2010，第3作者

22、 Positive selection drives population differentiation in the skeletal genes in modern humans，Human Molecular Genetics，2010, 19(12): 2341-2346.第1作者

23、 Evidence for positive selection on the Osteogenin (BMP3) gene in human populations.，PLoS one，2010，第1作者  

24、 A profound role for the expansion of trypsin-like serine protease family in the evolution of hematophagy in mosquito.，Molecular Biology and Evolution， 2009, 26(10): 2333-2341.第1作者

25、 Molecular evolution of the keratin associated protein gene family in mammals, role in the evolution of mammalian hair. ，BMC Evolutionary Biology ，2008，第1作者

26、 Intriguing balancing selection on the intron 5 region of LMBR1 in human population.，PLoS one ，2008，第2作者

26、 Positive Darwinian selection in human population: a review，Chinese Science Bulletin，2008，第1作者

荣誉奖励：

1、基因组多样性与亚洲人群的演化，二等奖，国家级，2015。

2、卢嘉锡人才奖，部委级，2014。

3、基因组多样性与亚洲人群的演化，特等奖，省级，2013。

4、动物适应性进化的分子机制，一等奖，省级，2013。

5、中国科学院百篇优秀博士论文奖，院级级，2012。

中国科学院昆明动物所吴东东博士，长期从事分子进化和生物信息学研究，他利用比较基因组学和群体基因组学方法，探讨适应性进化机制，通过对这些分子适应性进化实例的阐述，总结出在基因组时代利用分子进化学方法研究适应性进化的研究思路、基本策略，在基因组时代背景下，基于这些大规模基因组数据，利用各种生物信息学和进化基因组学方法探讨物种适应性进化的遗传基础。

1．物种间宏进化研究

在物种间宏进化的大时间尺度上，发现了60个对人类大脑进化有重要影响的从头合成起源新基因，该成果于2011年发表在PLoS Genetics上(2011, 7(11):e1002379)。PLoS Genetics当期以perspective的形式报道了此项工作，认为其对进一步认识从头合成起源的进化方式及人类进化遗传机制具有重要的启示意义，Scientific American杂志亦对其作了专题报道。由于该工作在新基因认识方面的重要影响，吴东东博士受邀为进化学领域的重要杂志Molecular Phylogenetics and Evolution撰写综述。

2．物种内微进化研究

在物种内微进化的时间尺度上，发现定向选择在“形态、行为、生理”等三大性状的进化过程中发挥了重要作用，对理解定向选择对群体适应性进化的影响有重要意义，为揭示微进化模式提供了有价值的参考。具体地，发现人类骨骼基因在走出非洲之后，受达尔文正选择驱动出现了不同方向的快速进化，以适应走出非洲后面临的各种新环境。该研究在中性选择驱动骨骼形态进化的主流理论之外，补充了达尔文正选择对人类骨骼系统快速微进化的重要作用，为诠释人类进化等古老命题提供了新的视野。在家养动物方面，发现大脑偏好表达基因在家犬驯化过程中发生了快速进化，很可能由此促成了家犬社会化行为的转变，为行为等复杂性状的研究提供了新的思路。该研究于2013年发表在Molecular Biology and Evolution (2013, 30:1867-1876) 后，被The New York Times报道。进一步，在地方家犬藏獒中鉴定了12个与低氧适应相关的基因，包括已在藏族人群适应进化研究中发现的基因EPAS1，揭示了人类和家犬在共享环境下的趋同进化，对深入探讨家养动物快速适应极端环境的遗传机制有重要参考价值，为保护藏獒种质资源提供了重要信息。该工作于2014年发表在Molecular Biology and Evolution上(2014, 31: 1200-1205)，该杂志以news形式报道了此工作，Sciencedaily亦做了专题报道。

专家简介

吴东东，博士，中国科学院昆明动物所副研究员，硕士生导师，长期从事分子进化和生物信息学研究，2012年荣获中国科学院百篇优秀博士论文奖，2013年入选中国科学院青年创新促进会。他参与的“基因组多样性与亚洲人群的演化”项目获2013 年云南省自然科学奖特等奖，并入选2014年云南省十大科技进展；“动物适应性进化的分子机制”获2013 年云南省自然科学奖一等奖。