夏志强 海南大学热带作物学院副院长

夏志强，男，1982年10月，研究员，博士生导师，海南省南海青年名家，中国民族医药协会黎医药分会理事，热区石漠化山地绿色高效农业科技新联盟理事，中国热带作物学会国际合作工作委员会委员，美国加州大学戴维斯分校访问学者，海南大学三亚南繁研究院副院长。中央民族大学联合培养研究生导师，四川农业大学联合培养研究生导师，青海大学联合培养研究生导师，武汉理工大学联合培养研究生导师。采用现代基因组学技术解析、群体多组学分析，基因功能验证，挖掘热带作物高产、优质、营养高效、抗逆基因资源，跨物种比较热带作物的特有生物学性状与演化路径，完成了首个木薯、百香果、象草、芭蕉芋和美人蕉等精细基因组；完成了染色体级别小桐子、澳洲坚果、白兰等基因组；完成高度杂合的同源四倍体栽培马铃薯。主导基因组与生物信息数据库技术平台，开展主要热带生物的基因组与群体遗传多样性研究，揭示物种重要生物学性状演化规律，为这些生物的遗传改良和多样性保护提供理论基础和技术。针对育种4.0中巨大样本检测的问题，突破技术壁垒，探索全新技术，原创研发两代超低成本基因型分型技术，成功用于约50个物种，30000多份样品研究中。新一代Hyper-seq用于作物回交育种的遗传背景筛选、基因分型、标记辅助选择检测、生物安全防控等。创建高效、快速的分子育种体系及热带作物基因组数据库服务系统。国家发明专利授权4项，国际发明专利授权3项，国家军事标准2项，一项专报获得国务院采纳，获得全国颠覆性技术大赛领域赛优秀奖。在Innovation、Plant Biotechnology Journal、Nucleic Acids Research、 Molecular Horticulture、Horticulture Research、Biotechnol Biofuels、Molecular Ecology Resources、Nature、Nature Communications等SCI杂志发表具有影响力的学术论文，其中第一作者或通讯作者约40篇。Molecular Horticulture，Horticulture Research，Biotechnol Biofuels等期刊常年审稿人，Tropical Plants副主编。担任2项国家重点研发项目专题负责人，主持和参加国家自然科学基金、重点基金、科技部973项目、国家木薯产业体系等科研项目10余项。 

教育背景：

2016.01-2017.11 美国 加州大学戴维斯分校UCDavis 访问学者/生物信息学

2012.09-2018.12 中国 华中农业大学 作物遗传育种 博士

2005.09-2008.06 中国 海南大学 作物遗传育种 硕士

2001.09-2005.06 中国 华南热带农业大学 生物技术 学士

工作经历：

2021.01-至今 中国 海南大学 研究员

2020.07-2021.01 中国 海南大学 副研究员

2018.01-2020.07 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 副研究员

2013.01-2017.12 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 助理研究员

2008.12-2012.12 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 研究实习员

编审

2017年7月-至今 Acta Physiologiae Plantarum国际学术期刊（SCI）

2018年12月-至今 Plos One国际学术期刊（SCI）

2018年2月-至今 Plant Physiology and Biochemistry 国际学术期刊（SCI）

2018年1月-至今 Frontiers of Agricultural Science and Engineering国际学术期刊（SCI）

2019年6月-至今 Industrial Crops and Products国际学术期刊（SCI 一区）

2019年12月-至今 Biotechnol Biofuels 国际学术期刊（SCI 一区）

2020年1月-至今 Horticulture Research国际学术期刊（SCI一区）

2022年1月-至今 Molecular Horticulture 国际学术期刊（SCI一区）

 

开设课程：     

基因组学（研究生），生物信息学（研究生），南繁育种（本科）

招生专业：

博士：作物遗传育种

硕士：作物学/农艺与种业/资源利用与植物保护

 研究领域：

基因组与大数据育种

承担科研项目：

1. 国家重点研发计划项目，2019YFD1000500，热带作物种质资源精准评价与基因发掘，2019.01-2022.12，120万，已结题，专题负责人。

2. 国家重点研发计划项目，2019YFD1001100，热带作物高效育种技术与品种创制，2019.01-2022.12，200万，已结题，专题负责人。

3. 国家自然科学基金青年基金项目，31301102，基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM），2014.01-2016.12，23万元，已结题，主持。

4. 滇桂黔石漠化地区特色作物产业发展关键技术集成示范项目，SMH2019-2021，石漠化地区特色作物指纹图谱开发，2019.01-2022.12，60万，在已结题，主持。

5. 2016年中国家留学基金管理委员会资助项目，2016.10-2017.11，已结题，主持。

6. 海南省自然科学基金面上项目，木薯干旱胁迫DNA甲基化变化及其相关代谢途径的响应，2016.01-2017.12，已结题，主持。

7. 国家重点基础研究发展规划(973)项目: 木薯淀粉高效累积途径及其关键基因，2010.01-2014.12，已结题，主要参加人。

8. 科技部国际合作重点项目，中南美洲热带作物种质收集与共同研究，2011.01-2014.12，已结题，主要参加人。

认定成果：

1 木薯全基因组关联分析及分子设计育种模型 王文泉;夏志强;邹枚伶;卢诚;周新成;王海燕;彭明;廖文彬;阮孟斌;叶剑秋 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2017

2 木薯干旱胁迫DNA甲基化变化及其相关代谢途径的响应 夏志强;邹枚伶;陈新;周新成;张圣奎;冯素彬 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2017

3 热带作物木薯逆境条件下高产的遗传基础及分子设计育种 曾长英;陈新;阮孟斌;夏志强;李淑霞;胡伟;赵平娟;王文泉;彭明 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2017

4 利用改良型cDNA-AFLP技术筛选木薯抗旱相关基因 陈新;曾长英;夏志强;宋顺;漆雪琳 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2013

5 海南几种珍稀濒危和重要经济植物遗传多样性研究 卢诚;王海燕;周新成;王文泉;邹枚伶;陈新;夏志强;符国瑷;潘坤;文明富;付瑜华 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2012

国外专利：

[1]Whole Genome High-Efficiency Gene Region Enriching and Sequencing Method 2021105278 2021.8 1 国际发明专利

[2]A Simple, Cost-effective and Amplification-based Whole Genome Sequencing Approach 2020/06979 2021.6 1 国际发明专利

[3]SIMPLIFIED SEQUENCING METHOD OF SPATIAL TRANSCRIPTOME AND USE THEREOF，LU502630 2023.7.13 国际发明专利

发明公开：

[1]夏志强, 罗璇, 田阳阳, 江思容, 赵龙, 夏成材, 李子璇, 邹枚伶. 一种全基因DNA数据再定义方法[P]. 海南省: CN118430645A, 2024-08-02.

[2]夏志强, 江思容, 邹枚伶. 一种基于最小熵算法的基因表达网络分析方法[P]. 海南省: CN116884487A, 2023-10-13.

[3]夏志强, 田阳阳, 江思容, 赵龙, 夏成材, 邹枚伶. 一种全基因DNA数据的定义方法[P]. 海南省: CN116705155A, 2023-09-05.

[4]邹枚伶, 安鹏良, 夏志强, 肖建加, 王文泉, 江思容. 一种与荔枝果实直径相关的SNP分子标记及其应用[P]. 海南省: CN116411115A, 2023-07-11.

[5]邵春艳, 王怀强, 夏志强, 李元颉. 一种裂缝测量方法、装置、设备及存储介质[P]. 海南省: CN116416233A, 2023-07-11.

[6]邵春艳, 夏志强, 王怀强, 李元颉. 一种裂缝图像增强方法、装置、设备及存储介质[P]. 海南省: CN116402718A, 2023-07-07.

[7]夏志强, 田阳阳, 邹枚伶, 江思容, 王文泉, 肖建加. 一种用于构建荔枝SNP指纹图谱的SNP位点组合、应用及鉴定方法[P]. 海南省: CN115927731A, 2023-04-07.

[8]夏志强, 余芬, 邹枚伶, 王文泉, 彭明. 一种用于构建甘蔗DNA指纹图谱的分子标记组合及其应用[P]. 海南省: CN115820923A, 2023-03-21.

[9]邹枚伶, 王文泉, 江思容, 夏志强, 张辰笈, 孙倩. DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备[P]. 海南省: CN111883212A, 2020-11-03.

[10]夏志强, 邹枚伶. 测序引物组及基于PCR的全基因组测序方法[P]. 浙江省: CN111763668A, 2020-10-13.

[11]夏志强, 邹枚伶, 王文泉, 张圣奎, 冯素彬. 一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法[P]. 海南: CN106701939A, 2017-05-24.

[12]夏志强, 邹枚伶, 王文泉, 张圣奎, 冯素彬. 一种全基因组高效基因区富集测序方法[P]. 海南: CN106636065A, 2017-05-10.

[13]夏志强, 邹枚伶, 王文泉. 基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法[P]. 海南: CN103882147A, 2014-06-25.

发明授权：

[1]夏志强, 邹枚伶. 测序引物组及基于PCR的全基因组测序方法[P]. 浙江省: CN111763668B, 2022-03-22.

[2]夏志强, 邹枚伶, 王文泉, 张圣奎, 冯素彬. 一种全基因组高效基因区富集测序方法[P]. 海南省: CN106636065B, 2021-12-14.

[3]邹枚伶, 王文泉, 江思容, 夏志强, 张辰笈, 孙倩. DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备[P]. 海南省: CN111883212B, 2021-11-26.

 

 

 

代表英文论文：

[1] Gu, Jinbao; Ma, Xiaowen; Ma, Qiuxiang; Xia, Zhiqiang; Lin, Yan; Yuan, Jianbo; Li, Yang; Li, Cong; Chen, Yanhang; Wang, Wenquan; Zhang, Peng; Wang, Zhen-Yu*.RNA splicing modulates the postharvest physiological deterioration of cassava storage root.Plant Physiology, 2024.

[2]Kang, Hailong; Huang, Tianhao; Duan, Guangya; Meng, Yuyan; Chen, Xiaoning; He, Shuang; Xia, Zhiqiang; Zhou, Xincheng; Chao, Jinquan; Tang, Bixia; Wang, Zhonghuang; Zhu, Junwei; Du, Zhenglin; Sun, Yanlin; Zhang, Sisi; Xiao, Jingfa; Tian, Weimin; Wang, Wenquan; Zhao, Wenming.TCOD: an integrated resource for tropical crops.Nucleic Acids Research, 2024, 52(D1): D1651-D1660.

[3]Sirong Jiang, Meiling Zou, Chenji Zhang, wanfeng Ma, Chengcai Xia, Zixuan Li, Long Zhao, Qi Liu, Fen Yu, Dongyi Huang*, Zhiqiang Xia*. A high-quality haplotype genome of Michelia alba DC reveals differences in methylation patterns and flower characteristics. 2024. (Mol Horticulture , IF: 10.6，一区，通讯作者）

[4]Jiang, Sirong; An, Pengliang; Xia, Chengcai; Ma, Wanfeng; Zhao, Long; Liang, Tiyun; Liu, Qi; Xu, Rui; Huang, Dongyi*; Xia, Zhiqiang*; Zou, Meiling*. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the SUT Family from Three Species of Sapindaceae Revealed Their Role in the Accumulation of Sugars in Fruits. Plants-Basel, 2024, 13(1): 95., 通讯作者

[5]Bao, Yuting; He, Miaohua; Zhang, Chenji; Jiang, Sirong; Zhao, Long; Ye, Zhengwen; Sun, Qian; Xia, Zhiqiang*; Zou, Meiling*. Advancing understanding of Ficus carica: a comprehensive genomic analysis reveals evolutionary patterns and metabolic pathway insights.Frontiers in Plant Science, 2023, 14: 1298417. （ IF: 4.1，通讯作者）

[6]Zhao L, Zou M, Deng K, Xia C, Jiang S, Zhang C, Ma Y, Dong X, He M, Na T, Wang J, Xia Z*, Wang F*. Insights into the genetic determination of tuber shape and eye depth in potato natural population based on autotetraploid potato genome. 2023 Mar 28;14:1080666（Frontiers in Plant Science IF: 4.1，通讯作者）

[7]Zhao, Long, Meiling Zou, Sirong Jiang, Xiaorui Dong, Ke Deng, Tiancang Na, Jian Wang, Zhiqiang Xia*, and Fang Wang. Insights into the Genetic Determination of the Autotetraploid Potato Plant Height 2023.（Genes IF: 4.141，通讯作者）

2022

[8]Meiling Zou, Zhiqiang Xia*. Hyper-seq: novel effective, flexible and great potential marker-assisted selection and genotyping approach 2022 (The Innovation, IF: 32.1，一区，通讯作者)

[9]Wang Fang#，Xia Zhiqiang#*，Zou Meiling#，Zhao Long，Jiang Sirong，Zhou Yun，Zhang Chenji，Ma Yongzhen; Bao Yuting，Sun Haihong，Wang Wenquan*; Wang Jian*. The autotetraploid potato genome provides insights into highly heterozygous species 2022（Plant Biotechnology Journal IF: 13.263，一区，第一作者与通讯作者）

[10]Zhang, Shengkui; Xia, Zhiqiang; Li, Can; Wang, Xiaohan; Lu, Xianqin; Zhang, Wenqing; Ma, Haizhen; Zhou, Xincheng; Zhang, Weixiong; Zhu, Tingting; Liu, Pandao; Liu, Guodao; Wang, Wenquan*; Xia, Tao*. Chromosome-Scale Genome Assembly Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.) Molecular Ecology Resources, 2022, 22(6): 2363-2378.（SCI收录，IF： 8.678，一区，第一作者）

[11]Fu, Yuhua; Jiang, Sirong; Zou, Meiling; Xiao, Jianjia; Yang, Long; Luo, Chunfang; Rao, Ping; Wang, Wenquan; Ou, Zhengui*; Liu, Fanzhi*; Xia, Zhiqiang*. High-quality reference genome sequences of two Cannaceae species provide insights into the evolution of Cannaceae. Frontiers in Plant Science, 2022, 13: 955904.（IF: 6.627 一区，通讯作者）

[12]Zou M#, Jiang S#, Wang F, Zhao L, Zhang C, Bao Y, Chen Y and Xia Z* (2022) Feature Compression Applications of Genetic Algorithm. Frontiers in Genetics 13:757524. doi: 10.3389/fgene.2022.757524 SCI收录，IF： 4.772，通讯作者）

[13]Zou Meiling; Xia Zhiqiang.Hyper-seq: A novel, effective, and flexible marker-assisted selection and genotyping approach.Innovation, 2022, 3(4).

2021

[14]Xia, Zhiqiang; Huang, Dongmei; Zhang, Shengkui; Wang, Wenquan; Ma, Funing; Wu, Bin; Xu, Yi; Xu, Bingqiang; Chen, Di; Zou, Meiling; Xu, Huanyu; Zhou, Xincheng; Zhan, Rulin*; Song, Shun*. Chromosome-Scale Genome Assembly Provides Insights into the Evolution and Flavor Synthesis of Passion Fruit (Passiflora edulis Sims) .Horticulture Research, 2021, 8(1): 14.（ IF：7.291，一区，第一作者）

[15]Kaixing Fang, Zhiqiang Xia, Hongjian Li, Xiaohui Jiang, Dandan Qin, Qiushuang Wang, Qing Wang, Chendong Pan, Bo Li and Hualing Wu, Genome-wide Association Analysis Identifies Molecular Markers Asociated with Tea Flavor-related Metabolites 2021（Horticulture Research, IF：7.291，一区，第一作者）

[16] Fang Wang#, Meiling Zou#, Long Zhao, Zhiqiang Xia* and Jian Wang*. (2021). Genome-Wide Association Analysis of Late Blight Resistance Traits in Potato Germplasm Resources. Frontiers in Genetics ., 01 October 2021 10.21203/rs.3.rs-113697/v1（SCI收录，IF：4.599，通讯作者）

[17] Wang, Fang; Zou, Meiling; Zhao, Long; Xia, Zhiqiang*; Wang, Jian*.Genome-Wide Association Mapping of Late Blight Tolerance Trait in Potato (Solanum tuberosum L.).Frontiers in Genetics, 2021, 12: 714575.

[18] Wang, Haiyan; Zhao, Pingjuan; Shen, Xu; Xia, Zhiqiang; Zhou, Xincheng; Chen, Xin; Lu, Cheng; WenquanWang.Genome-wide survey of the phosphofructokinase family in cassava and functional characterization in response to oxygen-deficient stress.BMC Plant Biology, 2021, 21(1): 376.

2020

[19]Gu J#, Xia Z#, Luo Y, Jiang X, Qian B, Xie H, Zhu J, Xiong L, Zhu J, Wang Z. Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res, 2018, 46(4):1777-1792.（SCI收录，IF：11.561，第一作者）

[20]Shengkui Zhang(#), Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan  Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong  Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango,  Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly  Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass  Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.)  bioRxiv,2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.28.970749 （第一作者）

[21]Congshan Xu 1,†, Zhiqiang Xia 2,†, Zhiqiang Huang 3, Chao Xia 4, Jing  Huang 1, Manrong Zha 5, Shujuan Wang 1, Muhammad Imran 1,6, Shaun  Casteel 1,  Yiwei Jiang 1, Cankui Zhang 1,7,*Understanding the  Physiological and Transcriptional Mechanism of Reproductive Stage  Soybean in Response to Heat Stress 2020 Crop Breed Genet Genom  2020;2(1):e200004.

2019

[22]Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping. Scientific Reports, 2014, 4: 7300. （SCI收录，IF：5.578，第一作者）

[23]Tang Yan Qiong*; Xia Zhi Qiang; Ding Ze Ting; Ding Ya Cao; Liu Zhu; Ma Xiang; Liu Jin Ping*. Construction of a  high-density linkage map and QTL mapping for important agronomic traits  in Stylosanthes guianensis (Aubl.) Sw. Scientific Reports, 2019,  9:3834.（影响因子：4.36，第一作者）

[24]Yu, Xin-Yi; Yao, Yuan; Hong, Yu-Hui; Hou, Peng-Yu; Li, Chun-Xia; Xia, Zhi-Qiang; Geng, Meng-Ting*; Chen, Yin-Hua*.Differential expression of the Hsf family in cassava under biotic and abiotic stresses.Genome, 2019, 62(8): 563-569.

[25]Yang Cui Ping; Xia Zhi Qiang; Hu Jin; Zhuang Yu Fen; Pan Ying Wen; Liu Jin Ping*.Transcriptome analysis of Oncidium petals provides new insights into the initiation of petal senescence.Journal of Horticultural Science & Biotechnology, 2019, 94(1): 12-23.

[26]Shiguo Li; Yiyong Chen; Yangchun Gao; Zhiqiang Xia; Aibin Zhan.Chemical oxidants affect byssus adhesion in the highly invasive fouling mussel Limnoperna fortunei.Science of the Total Environment, 2019, 1367-1375.

2018

[27]Xia, Zhiqiang; Zhang, Shengkui; Wen, Mingfu; Lu, Cheng; Sun, Yufang; Zou, Meiling; Wang, Wenquan .Construction of an ultrahigh-density genetic linkage map for Jatropha curcas L. and identification of QTL for fruit yield. Biotechnol Biofuels, 2018, 11: 3-3.（SCI收录，IF：5.497，第一作者）

[28]Xia, Zhiqiang; Liu, Kede; Zhang, Shengkui; Yu, Wencai; Zou, Meiling*; He, Ligang*; Wang, Wenquan*. An ultra-high density map allowed for mapping QTL and candidate genes controlling dry latex yield in rubber tree. Industrial Crops and Products, 2018, 120:351-356. （SCI收录，IF：3.849，第一作者）

[29]Ma, Ping'an; Chen, Xin*; Liu, Chen; Xia, Zhiqiang; Song, Yu; Zeng, Changying; Li, Youzhi; Wang, Wenquan*.MePHD1 as a PHD-Finger Protein Negatively Regulates ADP-Glucose Pyrophosphorylase Small Subunit1a Gene in Cassava.International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19(9): 2831.

[30]Shang Sang; Wu Chunlai; Huang Chao; Tie Weiwei; Yan Yan; Ding Zehong; Xia Zhiqiang; Wang Wenquan; Peng Ming; Tian Libo; Hu Wei.Genome-Wide Analysis of the GRF Family Reveals Their Involvement in Abiotic Stress Response in Cassava.Genes, 2018, 9(2): 110..（影响因子：3.49）

[31]Hu Wei*; Yan Yan; Tie Weiwei; Ding Zehong; Wu Chunlai; Ding Xupo; Wang Wenquan; Xia Zhiqiang; Guo Jianchun*; Peng Ming*.Genome-Wide Analyses of Calcium Sensors Reveal Their Involvement in Drought Stress Response and Storage Roots Deterioration after Harvest in Cassava.Genes, 2018, 9(4): 221.（影响因子：3.49）

[32]Ou W#, Mao X#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Wu C, Xia Z, Wang W,  Zhou S, Li K, Hu W. Genome-Wide Identification and Expression Analysis  of the KUP Family under Abiotic Stress in Cassava (Manihot esculenta  Crantz). Frontiers in Physiology. 2018; 9: 17.（影响因子：3.66）

[33]Xu C#, Xia C#, Xia Z, Zhou X, Huang J, Huang Z, Liu Y, Jiang Y, Casteel  S, Zhang C. Physiological and transcriptomic responses of reproductive  stage soybean to drought stress. Plant Cell Reports 2018, 37:1611-1624.

[34]Zhang Shengkui; Chen Xin; Lu Cheng; Ye Jianqiu; Zou Meiling; Lu Kundian; Feng Subin; Pei Jinli; Liu Chen; Zhou Xincheng; Ma Ping'an; Li Zhaogui; Liu Cuijuan; Liao Qi; Xia Zhiqiang*; Wang Wenquan*. Genome-Wide Association  Studies of 11 Agronomic Traits in Cassava (Manihot esculenta Crantz).  Frontiers in Plant Science, 2018, 9:503. （SCI收录，IF：3.678，通讯作者）

[35]Yang C#,Xia Z#, Hu J, Zhuang Y, Pan Y, Liu J. Transcriptome analysis  of Oncidium petals provides new insights into the initiation of petal  senescence. Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 2018,  94(1):1-12.（影响因子：0.715，第一作者）

[36]Pei, Jinli; Zhang, Shengkui; Xia, Zhiqiang; Chen, Xin; Liu, Chen; Zhou, Xincheng; Ma, Pingan; Wang, Wenquan*.Phylogenetic Analysis and Expression Profiles of Starch Phosphorylase Family Genes in Cassava under Diverse Environments.Crop Science, 2018, 58(3): 1181-1191.

[37]Gu, Jinbao; Xia, Zhiqiang; Luo, Yuehua; Jiang, Xingyu; Qian, Bilian; Xie, He; Zhu, Jian-Kang; Xiong, Liming; Zhu, Jianhua; Wang, Zhen-Yu.Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana.Nucleic Acids Res, 2018, 46(4): 1777-1792.

2017

[38]Ye, Jianqiu; Yang, Hai; Shi, Haitao; Wei, Yunxie; Tie, Weiwei; Ding, Zehong; Yan, Yan; Luo, Ying; Xia, Zhiqiang; Wang, Wenquan; Peng, Ming; Li, Kaimian*; Zhang, He*; Hu, Wei* The MAPKKK gene family in cassava:  Genome-wide identification and expression analysis against drought  stress. Scientific reports 2017, 7: 14939.（影响因子：4.259）

[39]Ma, Ping'an; Chen, Xin; Liu, Chen; Meng, Yuhong; Xia, Zhiqiang; Zeng, Changying; Lu, Cheng; Wang, Wenquan.MeSAUR1, Encoded by a Small Auxin-Up RNA Gene, Acts as a Transcription Regulator to Positively Regulate ADP-Glucose yrophosphorylase Small Subunit1a Gene in Cassava.Frontiers in Plant Science, 2017, 8: 1315.

[40]Zou, Meiling; Lu, Cheng; Zhang, Shengkui; Chen, Qing; Sun, Xianglai; Ma, Pingan; Hu, Meizhen; Peng, Ming; Ma, Zilong; Chen, Xin; Zhou, Xincheng; Wang, Haiyan; Feng, Subin; Fang, Kaixin; Xie, Hairong; Li, Zaiyun; Liu, Kede; Qin, Qiongyao; Pei, Jinli; Wang, Shujuan; Pan, Kun; Hu, Wenbin; Feng, Binxiao; Fan, Dayong; Zhou, Bin; Wu, Chunling; Su, Ming; Xia, Zhiqiang; Li, Kaimian; Wang, Wenquan.Epigenetic map and genetic map basis of complex traits in cassava population.Scientific Reports, 2017, 7: 41232. （SCI收录，IF：4.259，通讯作者）

[41]Luo, Ming-Cheng; Gu, Yong Q; Puiu, Daniela; Wang, Hao; Twardziok, Sven O; Deal, Karin R; Huo, Naxin; Zhu, Tingting; Wang, Le; Wang, Yi; McGuire, Patrick E; Liu, Shuyang; Long, Hai; Ramasamy, Ramesh K; Rodriguez, Juan C; Van, Sonny L; Yuan, Luxia; Wang, Zhenzhong; Xia, Zhiqiang; Xiao, Lichan; Anderson, Olin D; Ouyang, Shuhong; Liang, Yong; Zimin, Aleksey V; Pertea, Geo; Qi, Peng; Bennetzen, Jeffrey L; Dai, Xiongtao; Dawson, Matthew W; Muller, Hans-Georg; Kugler, Karl; Rivarola-Duarte, Lorena.Genome sequence of the progenitor of the wheat D genome Aegilops tauschii.Nature, 2017, 551(7681): 498-502.（SCI收录，IF：41.577）

[42]Ding, Zehong*; Fu, Lili; Yan, Yan; Tie, Weiwei;Xia, Zhiqiang; Wang, Wenquan; Peng, Ming; Hu, Wei*; Zhang, Jiaming*.Genome-wide characterization and expression profiling of HD-Zip gene family related to abiotic stress in cassava.PLos One, 2017, 12(3): e0173043.

2016

[43]Hu, Meizhen; Hu, Wenbin; Xia, Zhiqiang; Zhou, Xincheng; Wang, Wenquan*. Validation of Reference Genes for  Relative Quantitative Gene Expression Studies in Cassava (Manihot  esculenta Crantz) by Using Quantitative Real-Time PCR. Frontiers in  plant science 2016, 7:680（SCI，IF：3.678）

[44]Wei, Yunxie; Shi, Haitao; Xia, Zhiqiang; Tie, Weiwei; Ding, Zehong; Yan, Yan; Wang, Wenquan; Hu, Wei*; Li, Kaimian*  Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene  Family in Cassava. Frontiers in plant science 2016, 7,  25:1-18（SCI收录，IF：4.291，第一作者）

[45]Hao, Chaoyun; Xia, Zhiqiang; Fan, Rui; Tan, Lehe; Hu, Lisong; Wu, Baoduo; Wu, Huasong*. De novo transcriptome  sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) and an analysis of genes  involved in phenylpropanoid metabolism in response to Phytophthora  capsici. BMC Genomics, 2016, 17(1): 822-822.(SCI收录，IF：3.729, 第一作者）

[46]Hu, Wei*; Hou, Xiaowan; Xia, Zhiqiang; Yan, Yan; Wei, Yunxie; Wang, Lianzhe; Zou, Meiling; Lu, Cheng; Wang, Wenquan*; Peng, Ming*.Genome-wide survey and expression analysis of the calcium-dependent protein kinase gene family in cassava.Molecular Genetics and Genomics, 2016, 291(1): 241-253..（SCI收录，IF：2.979，第一作者）

2015

[47]Hu, Wei*; Xia, Zhiqiang; Yan, Yan; Ding, Zehong; Tie, Weiwei; Wang, Lianzhe; Zou, Meiling; Wei, Yunxie; Lu, Cheng; Hou, Xiaowan; Wang, Wenquan; Peng, Ming. Genome-wide gene phylogeny of CIPK family in cassava  and expression analysis of partial drought-induced genes. Frontiers in  plant science 2015, 6: 914.（SCI收录，IF：4.495，第一作者）

[48]Liu, Jin-Ping*; Xia, Zhi-Qiang; Tian, Xiao-Yan; Li, Yi-Jian. Transcriptome sequencing and analysis of  rubber tree (Hevea brasiliensis Muell.) to discover putative genes  associated with tapping panel dryness (TPD). BMC Genomics 2015,16:398.  （SCI收录，IF：3.867，第一作者）

[49]Hu, Wei*; Wei, Yunxie; Xia, Zhiqiang; Yan, Yan; Hou, Xiaowan; Zou, Meiling; Lu, Cheng; Wang, Wenquan; Peng, Ming.  Genome-wide identification and expression analysis of the NAC  transcription factor family in cassava. PloS one 2015, 10(8):  e0136993.（SCI收录，IF：3.057，第一作者）

[50]Chen, Xin; Xia, Jing; Xia, Zhiqiang; Zhang, Hefang; Zeng, Changying; Lu, Cheng; Zhang, Weixiong; Wang, Wenquan. Potential  functions of microRNAs in starch metabolism and development revealed by  miRNA transcriptome profiling of cassava cultivars and their wild  progenitor. BMC Plant Biology 2015, 15:33（SCI，IF：3.930）

[51]Pei, Jinli; Wang, Huijun; Xia, Zhiqiang; Liu, Chen; Chen, Xin; Ma, Pingan; Lu, Cheng; Wang, Wenquan*. Phylogeny and  expression pattern of starch branching enzyme family genes in cassava  (Manihot esculenta Crantz) under diverse environments.  Molecular and Cellular Biochemistry, 2015, 406(1-2): 273-284.（SCI，IF：2.561）

2014

[52]Wang, Wenquan; Feng, Binxiao; Xiao, Jingfa; Xia, Zhiqiang; Zhou, Xincheng; Li, Pinghua; Zhang, Weixiong; Wang, Ying; Moller, Birger Lindberg; Zhang, Peng; Luo, Ming-Cheng; Xiao, Gong; Liu, Jingxing; Yang, Jun; Chen, Songbi; Rabinowicz, Pablo D.; Chen, Xin; Zhang, Hong-Bin; Ceballos, Henan; Lou, Qunfeng; Zou, Meiling; Carvalho, Luiz J. C. B.; Zeng, Changying; Xia, Jing; Sun, Shixiang; Fu, Yuhua; Wang, Haiyan; Lu, Cheng; Ruan, Mengbin; Zhou, Shuigeng; Wu, Zhicheng; Liu, Hui.Cassava genome from a wild ancestor to cultivated varieties.Nature Communications, 2014, 5: 5110.（SCI收录，IF：11.470，第二作者）

[53]Zhiqiang Xia*; Meiling Zou; Shengkui Zhang; Binxiao Feng; Wenquan wang*.AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping.Scientific Reports, 2014, 4(7300): 7300.

[54]Chen, Xin; Fu, Yuhua; Xia, Zhiqiang; Jie, Li; Wang, Haiyan; Lu, Cheng; Wang, Wenquan*.Analysis of QTL for yield-related traits in cassava using an F-1 population from non-inbred parents.Euphytica, 2012, 187(2): 227-234.

[5]Zou, Meiling; Xia, Zhiqiang; Lu, Cheng; Wang, Haiyan; Ji, Jiamin; Wang, Wenquan.Genetic Diversity and Differentiation of Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg Revealed by ISSR and SRAP Markers.Crop Science, 2012, 52(5): 2304-2313. (SCI，IF：1.513, 第一作者)

[55]Zou, Meiling; Xia, Zhiqiang; Ling, Peng; Zhang, Yang; Chen, Xin; Wei, Zusheng; Bo, Weiping; Wang, Wenquan.Mining EST-Derived SSR Markers to Assess Genetic Diversity in Cassava (Manihot esculenta Crantz).Plant Molecular Biology Reporter, 2011, 29(4): 961-971. (SCI，IF：2.153,  第一作者)

[56]Heping, Y.; Zongqiang, Z.; Qifang, W.; Yongyue, L.; Xia, Z.; Linxue, K. Preparation of Constant Viscosity Natural Rubber with Mercaptan.Kautschuk Gummi Kunststoffe, 2011, 64(5): 30-34.

[57]Chen, Xin; Xia, Zhiqiang; Fu, Yuhua; Lu, Cheng; Wang, Wenquan. Constructing a genetic linkage map  using an F-1 population of non-inbred parents in Cassava (Manihot  esculenta Crantz). Plant Molecular Biology Reporter, 2010, 28(4): 676-683.  (SCI，IF：0.825, 第一作者)

发表中文期刊论文：

[1]裴小华, 赵龙, 田阳阳, 王帅, 薛唯佳, 曲飞鸿, 翟珂, 吴双, 李梦桃, 张恒, 潘英文, 夏志强, 刘进平. 乙烯利处理文心兰花瓣转录组分析及花衰老相关基因挖掘[J]. 分子植物育种, 2024, 22 (07): 2127-2136.

[2]王轶菲, 鲍宇婷, 江思容, 张辰笈, 赵龙, 夏成材, 肖建加, 刘琪, 邓珂, 夏志强, 刘越. UPLC-MS/MS法测定海南益智果实挥发油成分[J]. 分子植物育种, 2023, 21 (19): 6500-6509.

[3]刘琪, 李子璇, 夏成材, 肖建加, 江思容, 邹枚伶* , 夏志强* . 优良黄皮品种的全基因组Survey分析[J]. 分子植物育种, 2023, 21 (13): 4229-4235.

[4]普天磊, 韩学琴, 罗会英, 邓红山, 邹枚伶, 金杰, 夏志强, 王文泉. 基于SNP标记的辣木群体遗传分析[J]. 热带作物学报, 2023, 44 (09): 1786-1793.

[5]李晨, 裴小华, 王帅, 曲飞鸿, 薛唯佳, 徐丹, 李梦桃, 王鹏, 张恒, 潘英文, 夏志强* , 刘进平* . 文心兰花瓣转录组分析与调控花瓣衰老关键基因挖掘[J]. 分子植物育种, 2022, 20 (22): 7354-7364.

[6]江思容, 夏志强, 张辰笈, 赵龙, 鲍宇婷, 付瑜华, 杨龙, 罗春芳, 饶萍, 欧珍贵* , 邹枚伶* . 芭蕉芋和美人蕉全基因组Survey分析[J]. 分子植物育种, 2022, 20 (03): 765-771.

[7]邹枚伶, 夏志强, 王文泉*. 植物群体DNA甲基化研究进展[J]. 热带农业科学, 2021, 41 (04): 49-59.

[8]陈思平, 郭培培, 秦晓威, 宗迎, 黄艳丽, 夏志强. 香露兜中2-乙酰-1-吡咯啉的鉴定与定量分析[J]. 食品工业, 2021, 42 (04): 463-467.

[9]张辰笈, 邹枚伶, 夏志强, 孙倩, 江思容, 王文泉*. 麻疯树杂交子代与亲本间基因组DNA甲基化分析[J]. 热带作物学报, 2021, 42 (03): 620-628.

[10]鲍宇婷; 邹枚伶; 邓珂; 刘琪; 夏成材; 肖建加; 何妙华; 夏志强.3个无花果品种成熟果实次生代谢产物差异分析.分子植物育种, 2021, 1-11.

[10]周新成, 夏志强, 陈新, 邹枚伶, 卢诚, 王海燕, 王文泉. 基因组学进展及其在热带作物领域中的应用[J]. 热带作物学报, 2020, 41 (10): 2130-2142.

[11]孙倩, 邹枚伶, 张辰笈, 江思容, Eder Jorge de Oliveira, 张圣奎, 夏志强, 王文泉, 李有志. 基于SNP和InDel标记的巴西木薯遗传多样性与群体遗传结构分析[J]. 作物学报, 2021, 47 (01): 42-49.

[12]卢诚, 陈新, 周新成, 夏志强, 孙玉芳, 王海燕, 邹枚伶, 李开绵, 李兆贵, 肖子盈, 周宾, 韩全辉, 张鹏, 王文泉. 木薯新品种‘华南16号’的选育[J]. 热带作物学报, 2020, 41 (09): 1756-1761.

[13]谭秋锦, 王文林, 陈海生, 韦媛荣, 郑树芳, 黄锡云, 贺鹏, 夏志强*. 基于SNP分子标记的澳洲坚果种质遗传多样性分析[J]. 分子植物育种, 2020, 18 (21): 7246-7253.

[14]冯素彬, 邹枚伶, 张圣奎, 夏志强, 王文泉. 木薯干旱胁迫下甲基化变化分析[J]. 分子植物育种, 2017, 15 (04): 1492-1498.

[15]丁泽红, 铁韦韦, 付莉莉, 颜彦, 夏志强, 王文泉, 胡伟. 木薯MePIL1基因克隆与表达分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32 (12): 72-78.

[16]丁泽红, 付莉莉, 铁韦韦, 颜彦, 夏志强, 王文泉, 胡伟. 木薯MeHB2转录因子的克隆与表达分析[J]. 西北植物学报, 2016, 36 (08): 1522-1527.

[17]胡伟, 颜彦, 韦运谢, 王文泉, 夏志强, 卢诚, 侯晓婉, 彭明. 木薯MeASR基因克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2015, 31 (10): 125-130.

[18]裴金利, 陈新, 夏志强, 刘陈, 马平安, 张圣奎, 王文泉. 木薯淀粉分支酶基因MeSBE2.2的克隆和表达分析[J]. 中国农业大学学报, 2015, 20 (04): 36-41.

[19]王宇阳, 陈新, 夏志强, 陈青, 王文泉. 利用改良型cDNA-AFLP技术筛选木薯干旱胁迫相关基因[J]. 热带作物学报, 2013, 34 (06): 1033-1040.

[20]胡文斌, 王文泉, 王海燕, 夏志强, 胡梅珍. 木薯MeSSSⅣ基因启动子克隆及序列分析[J]. 广东农业科学, 2013, 40 (12): 144-148.

[21]陈青, 夏志强, 陈新, 卢诚, 王宇阳, 王文泉. 木薯分子标记遗传连锁图谱的构建及相关性状QTL定位[J]. 热带作物学报, 2013, 34 (05): 829-837.

[22]孟凡超, 夏志强, 曾长英, 王文泉. 数字化表达谱差异分析方法-DGE-P[J]. 现代生物医学进展, 2013, 13 (02): 340-343+359.

[23]邹枚伶, 夏志强, 陈俊荣, 王文泉. 蓖麻EST资源的SSR信息分析与功能注释[J]. 热带作物学报, 2012, 33 (12): 2138-2143.

[24]夏志强, 陈新, 王海燕, 周新成, 王文泉. 简并引物设计与大戟科3种植物WAX基因片段的克隆[J]. 安徽农学通报(上半月刊), 2012, 18 (23): 32-34.

[25]邹枚伶, 夏志强, 卢诚, 王文泉. 中国白木香(Aquilaria sinensis(Lour.)Gilg)的研究进展[J]. 安徽农学通报(上半月刊), 2012, 18 (23): 51-53.

[26]付瑜华, 夏志强, 王海燕, 王文泉. 麻疯树叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶的BIBAC文库筛选及其生物信息学分析[J]. 中国农学通报, 2012, 28 (31): 21-28.

[27]吉家敏, 夏志强, 邹枚伶, 王文泉. 木薯SSR标记非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳条件的优化[J]. 现代农业科学, 2009, 16 (06): 34-36.

[28]杨鹏雅, 王文泉, 周建国, 李开绵, 夏志强. 木薯SAD基因片段的克隆及其序列分析[J]. 广东农业科学, 2009, (06): 28-30+42.

[29]吉家敏, 夏志强, 邹枚伶, 王文泉. 木薯群体重要农艺性状遗传连锁图谱和QTL分析[J]. 现代农业科学, 2009, 16 (05): 26-30.

[30]邹枚伶, 夏志强, 吉家敏, 陈新, 王海燕, 曾长英, 王文泉. 白木香SRAP-PCR反应体系的建立[J]. 基因组学与应用生物学, 2009, 28 (01): 137-140.

[31]邹枚伶, 夏志强, 王文泉. 白木香基因组DNA提取与ISSR反应体系的优化[J]. 中国农学通报, 2009, 25 (02): 250-254.

[32]夏志强, 邹枚伶, 王文泉. 木薯SRAP扩增体系的建立与优化[J]. 中国农学通报, 2008, (09): 457-460.

[33]韦祖生, 夏志强, 李开绵, 王文泉. 木薯种质库遗传多样性的EST-SSR标记[J]. 热带作物学报, 2008, (03): 304-309.

[34]夏志强, 邹枚伶, 曾长英, 陈新, 吉家敏, 刘晓静, 王文泉. 木薯块根淀粉积累分子机制综述[J]. 安徽农学通报, 2008, (08): 78-81+71.

[35]刘晓静, 王海燕, 张根良, 夏志强, 王文泉. 改良CTAB法提取益智基因组DNA[J]. 江西农业学报, 2007, (08): 111-112+114.

[36]王惠君, 和丽岗, 夏志强, 王海燕, 付瑜华, 卢诚, 王文泉. 橡胶树AFLP银染体系的建立和优化[J]. 生物技术通讯, 2007, (04): 631-634.

[37]王文泉; 卢诚; 陈新; 夏志强; 李开绵.基因组选择拓展木薯生物能源应用潜力.第三届中国国际生物质能源与生物质利用高峰论坛.

 

 

荣誉奖励：

1. 2015年海南省科技进步一等奖：木薯比较基因组及光合产物高效积累机理 2015-J-1-R-048，排名第四。

2. 2016-2017年度神农中华农业科技奖二等奖：木薯全基因组测序及育种基础 KJ2017-R2-012-03，排名第三。

3. 2016年世界块根块茎作物大会（World Congress On Root And Tuber Crops）大会Poster一等奖，排名第一。

4. 基于Hyper-seq的高通量群体测序技术的全基因组选择育种体系 全国颠覆性技术创新大赛领域赛优秀奖 2022年12月

——记海南大学热带作物学院副院长夏志强

2023-04-11

 

海南大地，炽热的阳光洒落在南繁育种基地的田埂上，万物生机勃勃。田地间、实验室里，多见身着工作服、忙碌不停的南繁科研育种工作者，他们的目光专注而热切，聚焦于每一轮的攻关实验，力求使成百上千种粮食作物在南海之滨的沃土中茁壮成长。

扎根海南十余年，夏志强及其带领的热带作物基因组大数据育种团队的日常工作在很多人看来繁复而枯燥——每天都要进行大量的数据处理和采样测序工作等，但他与同仁却乐此不疲，斗志激昂地奋战在让“金种子”变成“金饭碗”的科研第一线。这是他在大学时逐渐萌生的梦想，也得益于恩师王文泉教授的指引，“事实上，我最初对计算机专业情有独钟，但2001年却阴差阳错地进入了生物技术专业，多亏王教授给我参与分子育种实验的宝贵机会，让我得以发挥生物类专业的学术背景，并与自己的兴趣方向相结合，逐渐踏上这条人工智能大数据与农业研究的结合之路”。

2010年，夏志强开始认识到阻碍我国育种成苗技术进一步发展的瓶颈问题——大群体测序的成本始终居高不下。为解决这一难题，他翻阅了大量文献，却始终没能找到想要的答案。“既然无前人经验可考，就要努力开展自主创新。”但迢迢路远，谈何容易。于是，他只得一路前行，步履不停，十年磨剑终成器——2020年，依托于“常规育种+现代生物技术育种+信息化育种”的“4.0时代”背景，他与团队开发出了先进的“Hyper-seq测序”新技术。据夏志强介绍，这一技术仅需进行一轮聚合酶链式反应（PCR），便能完成构建测序文库，实现大量样品同时建库，并产出海量基因型大数据，通过人工智能算法，能够将低成本快速产生的上千万分子标记与性状数据进行有效的模型拟合，精确预测物种性状。这是目前基因分型方法中相对简便且成本较低的测序技术，也是解决育种“卡脖子”关键问题的高效方法之一。

截至目前，夏志强团队已在基因组水平上率先完成了首个木薯、百香果、象草、芭蕉芋、美人蕉的精细基因组，并相继解析了超2万份的热带物种资源群体基因型，为我国种业的组学技术创新奠定了基础。不仅如此，作为种子“成才”的加速器，智能化大数据育种技术手段在其他很多方面的表现也尤为出色：不仅可实现回交育种背景筛选和育种材料纯度鉴定，还可进行物种进化演化群体结构鉴定，进一步指纹追溯和揭示物种的进化。“未来，这些研究都将形成一套GS育种（全基因组选择育种）体系，从大数据基因型到训练模型，以便快速为育种家提供筛选优质材料的坚实依据。”对高通量测序技术辅助育种的未来发展，夏志强充满信心。

如今已接近《国家南繁科研育种基地（海南）建设规划（2015—2025年）》的尾声，却正值我国从“经验育种”走向“精确育种”的高速发展时期，夏志强表示将始终积极响应科技强国的号召，不仅要“藏粮于地”，更要“藏粮于技”，用奋斗不懈丰富百姓的食谱清单，倾毕生所学续写南繁之华章。

来源：科学中国人 2023年3期 创新之路