质循环消失了，而规模养殖业与种植业又脱节，新的农业物质循环没能形成。为什么？因为构建这种大物质循环的关键环节有机肥产业太拉胯，没有积极参与这种循环的自生动力，技术又跟不上，尤其是对海量的有机废水(沼液、粪污)束手无策。这不但使许多农业县环境污染严重，还使土地贫瘠化日益加剧。如今我国耕地土壤有机质含量平均已降到2%左右，仅为发达国家水平的57%。可见我国有机肥产业对土地培肥和农作物高产，并没有起到托底的作用。
二、有机肥产业困在落后产能陷井
全国绝大部分有机肥厂都执行好氧高温发酵多次翻堆热风烘干生产工艺